Attesa a lungo, nel 1989 venne presentata la versione con motore a 16 valvole della Lancia Delta Integrale. Il propulsore a 4 cilindri da 1995cc dava ora 200 cavalli a 5500 giri. Il nuovo motore montato sulla 16V derivava da quello della Thema Turbo 16V. Esternamente la Delta 16V si distingueva dalla precedente 8V per la vistosa gobba sul cofano. La velocità massima dichiarata era di 220 km/h contro i 215 del modello precedente.