Malgré les progrès montrés en 1993, 1994 sera une année très problématique pour Ligier, pour diverses raisons, notamment économiques et managériales. Ayant eu peu de temps durant l'hiver pour réfléchir aux aspects techniques et sportifs, l'équipe utilise une voiture de 1993 mise à jour, la JS39B, conservant les moteurs Renault. Au printemps 1994, Flavio Briatore acquiert l'équipe. Ligier terminera sixième du championnat des constructeurs, avec 13 points. Le meilleur des pilotes Ligier était Olivier Panis, 11e du championnat avec 9 points. Les autres pilotes de l'équipe étaient Eric Bernard, Johnny Herbert et Franck Lagorce.