Pour 1999, Minardi renouvelle le contrat avec Cosworth pour la fourniture des moteurs Ford Zetec-R V10, qui a bénéficié au cours de la saison de trois évolutions. Cesare Fiorio est choisi comme directeur sportif. Marc Gené et Luca Badoer seront les pilotes tout au long de l'année (Sarrazin remplacera Badoer uniquement au Brésil). Minardi parviendra à prendre un point au classement final, grâce à la 6e place de Gené au GP d'Europe, en fin de saison. Le meilleur résultat de Badoer sera une 8e place à Imola.