Commercialisée à partir d'octobre 1998, la Lupo, cousine de la Seat Arona, entendait concurrencer la Ford KA et la Renault Twingo, tout en conservant un trait moins audacieux, au moins d'un point de vue stylistique. Outre le modèle sportif GTI, les quatre moteurs à essence étaient un 1000cc de 50 chevaux, un 1400cc de 60 chevaux, un 1400cc 16v de 75 et 100 chevaux et les moteurs diesel étaient un 1700cc de 60 chevaux, un 1200cc de 61 chevaux et un 1400cc de 75 chevaux. Il existait six niveaux de finition. La 3L TDI, avec moteur diesel de 1200cc, était un exemple de raffinement technique, avec une boîte de vitesses robotisée, des éléments en aluminium et une très faible consommation (3 litres/100 km). La Lupo sortira de production en 2005.