Prima piccola GTI a 16 valvole, la Clio 16S, presentata nel 1990, riprendeva il motore tipo F7P da 1800cc e 140 cavalli della 19 16S. Meno vivace rispetto alla Peugeot 205 GTI, la Clio 16S aveva però un migliore comportamento su strada per quanto riguardava la precisione di guida e la motricità in uscita di curva. La 16S rimase in produzione fino al 1994, quando assunse la denominazione 16V.